Depuis 2018, la Fondation Mérieux soutient les activités de diagnostic et de recherche du Programme National de Lutte contre la Tuberculose au Liban dans un contexte de dégradation alarmante des infrastructures sanitaires du pays. En l’absence de recommandations nationales à jour sur le diagnostic et le traitement de l’infection tuberculeuse, la Fondation a mené une étude prenant en compte les spécificités démographiques et épidémiologiques liées à la présence de plusieurs populations à risque sur le territoire libanais : migrants, personnels de santé, cas contact et personnes incarcérées.

En 2025, les conclusions de ces travaux ont permis d’établir de nouvelles recommandations nationales pour le dépistage de l’infection tuberculeuse. Elles ont été présentées lors de la rencontre organisée par l’entreprise de santé libanaise FMPS Holding à l’occasion de la Journée mondiale de lutte contre la Tuberculose du 4 avril 2025.

Ces travaux ont également contribué à la publication du rapport « La tuberculose à la croisée des chemins : mesures urgentes pour la santé des migrants et des réfugiés en cette période troublée » dans le journal BMJ Global Health en septembre 2025. Du fait de son rôle stratégique au Liban, la Fondation Mérieux avait été sollicitée par l’OMS, en partenariat avec la Qatar Foundation, pour participer à la rédaction de ce rapport qui avance des recommandations politiques stratégiques pour lutter contre la maladie dans des contextes de crises et de restrictions budgétaires.

Lancé en 2022, le projet DEDICATE (Blood-based diagnostic of paucibacillary TB in Bangladesh) s’inscrit dans le plan de lutte contre de la tuberculose de l’OMS, avec l’objectif de réduire le sous-diagnostic de deux formes spécifiques de tuberculose : la tuberculose pédiatrique et la tuberculose extra-pulmonaire. Formes pauci-bacillaires de la maladie, c’est-à-dire présentant de faibles quantités d’agents infectieux, elles sont difficilement dépistables avec les méthodes conventionnelles basées sur l’analyse d’échantillons d’expectoration, un prélèvement en outre particulièrement difficile à réaliser chez les plus jeunes.

Coordonnée par la Fondation Mérieux, l’étude DEDICATE menée au Bangladesh évalue la performance de deux tests moléculaires sanguins – RISK6 et Xpert-MTB-HR – comme outils de triage et de diagnostic, mais aussi comme outils potentiels de suivi thérapeutique. Elle repose sur le suivi de deux cohortes en milieu hospitalier : des enfants de moins de 15 ans présentant une présomption de tuberculose pulmonaire et des cas suspects de tuberculose extra-pulmonaire.

Les résultats de l’étude ont fait l’objet d’une présentation lors de la Conférence Mondiale sur la Santé pulmonaire (World Conference on Lung Health) à Copenhague en novembre 2025 par Ashabul Islam, étudiant de l’Icddr,b (International Centre for Diarrhoeal Disease Research, Bangladesh) et lauréat 2024 du Prix GABRIEL des Jeunes scientifiques grâce aux travaux réalisés dans ce projet. En 2025, les résultats obtenus chez les enfants ont été publiés dans la revue scientifique IJTLD Open.

Financé en partenariat avec la Fondation AnBer et grâce au mécénat exceptionnel des actionnaires bioMérieux, DEDICATE est menée avec le soutien opérationnel de l’icddr,b et de Cepheid.

Lancée au Bangladesh en juillet 2025, l’étude RISK4Kids entend apporter une solution à la difficulté à distinguer la tuberculose de la pneumonie chez les enfants, en raison du recoupement des symptômes cliniques (toux, fièvre, détresse respiratoire) et du manque d’outils de diagnostic fiables. Cette difficulté diagnostique contribue à des taux élevés de traitements inadéquats et à l’émergence d’une résistance aux antimicrobiens.

Afin de faciliter le diagnostic différentiel de la tuberculose et de la pneumonie chez les enfants, l’étude propose d’évaluer deux outils de triage rapides utilisés individuellement ou de façon combinée : les biomarqueurs du sang et la mesure de la saturation du sang en oxygène. En complément, le projet introduira à titre expérimental l’intelligence artificielle dans l’interprétation des radiographies pulmonaires. Mené directement en milieu hospitalier, RISK4Kids sera déployé auprès d’enfants de moins de dix ans présentant des signes d’infection respiratoire.

Les étapes de mise en place de l’étude ont été réalisées en 2025 : validation du protocole, accord des comités d’éthiques locaux, mise en conformité réglementaire de la Fondation Mérieux en qualité de promoteur de l’étude, harmonisation de la documentation, achat des réactifs et consommables. Le recrutement a débuté en octobre 2025.

Le projet RISK4Kids est le fruit d’une coopération entre plusieurs hôpitaux bangladais, le BITID (Bangladesh Institute of Tropical and Infectious Diseases), l’Icddr,b (International Centre for Diarrhoeal Disease Research, Bangladesh) et la Fondation Mérieux, avec le soutien financier de la Fondation AnBer.

Extension du projet TRICYCLE de l’OMS, TRIuMPH (Tricycle Upscaling Monitoring for Public Health) avait pour objectif d’adapter et d’étendre le protocole TRICYCLE à l’échelle nationale, en vue d’une surveillance intégrée de la RAM en Malaisie, au Pakistan et à Madagascar. Démarré en 2020 dans le cadre d’un consortium international réunissant institutions de santé publique, laboratoires de recherche et centres de formation de Madagascar, des Pays-Bas, de France, de Malaisie et du Pakistan, le projet a pris fin en 2025.

Grâce à des méthodes simplifiées et harmonisées, le projet s’est centré sur Escherichia coli, utilisée comme espèce indicatrice des bactéries multirésistantes. Présente dans la santé humaine, la santé animale et l’environnement, E. coli a permis d’évaluer la circulation de la RAM à travers les trois piliers du concept « One Health ». L’amélioration du protocole TRICYCLE inclut également la recherche des Entérobactéries produisant le carbapénémase (CPE). La Fondation Mérieux était chargée de la caractérisation moléculaire des souches de CPE isolées dans le secteur humain à Madagascar, en lien avec les dix laboratoires hospitaliers du réseau RESAMAD et avec le Centre d’Infectiologie Charles Mérieux à Antananarivo.

En mettant en œuvre une approche simplifiée et intégrée de la surveillance de la résistance antimicrobienne, TRIuMPH a démontré la faisabilité d’un modèle transférable, durable et intersectoriel, au service des politiques nationales de santé publique. Le projet a été mis en œuvre grâce au soutien de bailleurs de fonds majeurs, en particulier de l’agence suédoise de coopération internationale au développement, qui a financé le programme JPIAMR (Joint Programming Initiative on Antimicrobial Resistance) dans le cadre duquel le projet a été conduit à Madagascar.

La réunion de clôture du consortium TRIuMPH a été organisée en septembre 2025 à l’Institut national de la Santé publique et de l’environnement des Pays-Bas. Les résultats des trois pays ayant mis en œuvre le projet ont été présentés aux ministères nationaux et aux organisations internationales, accompagnés d’un retour d’expérience sur la mise en œuvre de la surveillance.

Depuis 2007, l’OMS recommande l’introduction du vaccin PCV dans les programmes de vaccination infantile afin de lutter contre Streptococcus pneumoniae, l’un des principaux agents responsables des infections respiratoires basses chez les enfants de moins de cinq ans. Comme les bénéfices de cette stratégie varient selon le contexte, le taux de couverture vaccinale et la diversité des souches en circulation, la Fondation Mérieux a réalisé l’étude PCV dans le but de guider les décisions de santé publique et améliorer la lutte contre les infections pneumococciques dans les régions à haut risque.

L’étude porte sur l’évaluation de la prévalence de la colonisation par Streptococcus pneumoniae dans un contexte de déploiement récent du PCV : elle a été réalisée en milieu hospitalier au Cambodge, en Inde et au Paraguay chez les enfants de moins de cinq ans et leurs accompagnants adultes. Finalisée en 2025, elle a permis d’établir un protocole central pour générer les données de prévalence à travers les contextes épidémiologiques divers.

Les résultats délivrés par les laboratoires membres du réseau GABRIEL dans les trois pays d’étude montrent que la colonisation par le pneumocoque reste fréquente chez les enfants malgré l’introduction de la vaccination : plus de 30 % en Inde et au Cambodge et près de 40 % au Paraguay. L’étude révèle également un phénomène de remplacement sérotypique : c’est-à-dire le remplacement progressif des sérotypes vaccinaux par des souches non incluses dans le vaccin, indiquant que la dynamique des sérotypes demeure évolutive.

Ces données confirment l’importance de la surveillance pour ajuster les politiques vaccinales et anticiper l’émergence de nouveaux sérotypes potentiellement pathogènes. Au Paraguay, l’étude a également montré que la résistance aux antibiotiques est fréquente, et en augmentation par rapport à des études précédentes.